Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• edu.illinois.ncsa.clowder,
• edu.illinois.ncsa.clowder.dao,
• edu.illinois.ncsa.clowder.impl,
• edu.illinois.ncsa.datawolf,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.domain,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.event,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.event,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.commandline,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.handlers,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.ssh,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.tool,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.service,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.service.client,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.service.utils,
• edu.illinois.ncsa.datawolf.tool.example,
• edu.illinois.ncsa.domain,
• edu.illinois.ncsa.domain.dao,
• edu.illinois.ncsa.domain.event,
• edu.illinois.ncsa.domain.impl,
• edu.illinois.ncsa.domain.jackson,
• edu.illinois.ncsa.domain.util,
• edu.illinois.ncsa.file.service,
• edu.illinois.ncsa.file.service.client,
• edu.illinois.ncsa.gondola,
• edu.illinois.ncsa.gondola.types.service,
• edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission,
• edu.illinois.ncsa.gondola.utils,
• edu.illinois.ncsa.jpa,
• edu.illinois.ncsa.jpa.dao

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • edu.illinois.ncsa.domain.AbstractBean (implements java.io.Serializable)
    • edu.illinois.ncsa.domain.Account
    • edu.illinois.ncsa.domain.Dataset
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.Execution
    • edu.illinois.ncsa.domain.FileDescriptor
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.HPCJobInfo
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.LogFile
    • edu.illinois.ncsa.domain.Person
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.Submission
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.Workflow
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.WorkflowStep
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.WorkflowTool
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.WorkflowToolData
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.WorkflowToolParameter
  • edu.illinois.ncsa.clowder.dao.AbstractClowderDao<T,ID> (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.IDao<T,ID>)
    • edu.illinois.ncsa.clowder.dao.DatasetClowderDao (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.DatasetDao)
    • edu.illinois.ncsa.clowder.dao.FileDescriptorClowderDao (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.FileDescriptorDao)
    • edu.illinois.ncsa.clowder.dao.PersonClowderDao (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.PersonDao)
  • edu.illinois.ncsa.jpa.dao.AbstractJPADao<T,ID> (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.IDao<T,ID>)
    • edu.illinois.ncsa.jpa.dao.AccountJPADao (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.AccountDao)
    • edu.illinois.ncsa.jpa.dao.DatasetJPADao (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.DatasetDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.ExecutionJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.ExecutionDao)
    • edu.illinois.ncsa.jpa.dao.FileDescriptorJPADao (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.FileDescriptorDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.HPCJobInfoJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.HPCJobInfoDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.LogFileJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.LogFileDao)
    • edu.illinois.ncsa.jpa.dao.PersonJPADao (implements edu.illinois.ncsa.domain.dao.PersonDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.SubmissionJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.SubmissionDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.WorkflowJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.WorkflowStepJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowStepDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.WorkflowToolDataJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowToolDataDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.WorkflowToolJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowToolDao)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.jpa.dao.WorkflowToolParameterJPADao (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowToolParameterDao)
  • com.google.inject.AbstractModule (implements com.google.inject.Module)
    • edu.illinois.ncsa.clowder.ClowderDevModule
    • edu.illinois.ncsa.jpa.JPADevModule
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.PersistenceModule
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.ResourcesModule
    • com.google.inject.servlet.ServletModule
      • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.DataWolfServletModule
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.AccessType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.AuthenticationInterceptor (implements org.jboss.resteasy.spi.interception.PreProcessInterceptor)
  • edu.illinois.ncsa.domain.util.BeanUtil
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.BrownDogResource
  • java.lang.ClassLoader
    • java.security.SecureClassLoader
      • java.net.URLClassLoader (implements java.io.Closeable)
        • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.DisposeClassLoader
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.commandline.CommandLineImplementation
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.commandline.CommandLineOption
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.ConnectionType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.tool.Dataset
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.DatasetsResource
  • edu.illinois.ncsa.domain.util.DatasetUtil
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.client.DataWolfServiceClient
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.DateUtils
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.DbcpType
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.DbcpType.Property
  • org.apache.http.impl.client.DefaultRedirectStrategy (implements org.apache.http.client.RedirectStrategy)
    • org.apache.http.impl.client.LaxRedirectStrategy
      • edu.illinois.ncsa.clowder.ClowderRedirectStrategy
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.DropType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.Engine
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.ErrorHandlerType
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.Event.Type<H>
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.ExceptionUtils
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.ExecutionsResource
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.Executor
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.LocalExecutor (implements java.lang.Runnable)
      • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.commandline.CommandLineExecutor
      • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.JavaExecutor
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.RemoteExecutor (implements java.lang.Runnable)
      • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.HPCExecutor
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.ExecutorsResource
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.ExpressionGroupTranslatorType
  • edu.illinois.ncsa.file.service.client.FileServiceClient
  • edu.illinois.ncsa.file.service.FilesResource
  • edu.illinois.ncsa.clowder.impl.FileStorageClowder (implements edu.illinois.ncsa.domain.FileStorage)
  • edu.illinois.ncsa.domain.impl.FileStorageDisk (implements edu.illinois.ncsa.domain.FileStorage)
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.FileUtils
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.HPCToolImplementation
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.IdListType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.ImportExport
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.InitializeType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.JavaToolImplementation
  • edu.illinois.ncsa.gondola.utils.JAXBUtils
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.handlers.JobInfoParser
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.JobStatusListType
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.JobStatusType
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.JobSubmissionType
  • com.fasterxml.jackson.databind.JsonSerializer<T>
    • edu.illinois.ncsa.domain.jackson.JsonDateSerializer
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.LineType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.LogFilesResource
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.LoginResource
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.MyProxyType
  • edu.illinois.ncsa.gondola.NonNLSConstants
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.NonNLSConstants
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectCreatedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectCreatedHandler (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.EventHandler)
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.ObjectFactory
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.ObjectFactory
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectRemovedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectRemovedHandler (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.EventHandler)
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectSelectedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectSelectedHandler (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.EventHandler)
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectUpdatedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.domain.event.ObjectUpdatedHandler (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.EventHandler)
  • java.io.OutputStream (implements java.io.Closeable, java.io.Flushable)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.OutputPipe
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.tool.Parameter
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.ParserType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.PathUtils
  • edu.illinois.ncsa.domain.Persistence
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.PersonsResource
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.RegexType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.ResourceEntry
  • org.jboss.resteasy.plugins.server.servlet.ResteasyBootstrap (implements javax.servlet.ServletContextListener)
    • org.jboss.resteasy.plugins.guice.GuiceResteasyBootstrapServletContextListener (implements javax.servlet.ServletContextListener)
      • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.GuiceContextListener
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.ScriptType
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.service.ServiceType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.tool.example.ShiftCharsTool (implements edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.tool.JavaTool)
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.ssh.SSHInfo (implements com.jcraft.jsch.UserInfo)
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.ssh.SSHSession
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.SshUtils
  • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.StatusHandlerType
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.event.StepStateChangedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.StringUtils
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.SystemUtils
  • java.lang.Throwable (implements java.io.Serializable)
    • java.lang.Exception
      • edu.illinois.ncsa.datawolf.AbortException
      • edu.illinois.ncsa.datawolf.FailedException
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.hpc.util.UriUtils
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.WorkflowsResource
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.event.WorkflowToolChangedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.event.WorkflowToolCreatedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.event.WorkflowToolDeletedEvent (implements edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>)
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.WorkflowToolsResource
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.service.utils.WorkflowUtil

Interface Hierarchy

• edu.illinois.ncsa.domain.event.Event<H>
• edu.illinois.ncsa.domain.event.EventHandler
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.event.StepStateChangedHandler
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.event.WorkflowToolChangedHandler
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.event.WorkflowToolCreatedHandler
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.event.WorkflowToolDeletedHandler
• edu.illinois.ncsa.domain.FileStorage
• edu.illinois.ncsa.domain.dao.IDao<T,ID>
  • edu.illinois.ncsa.domain.dao.AccountDao
  • edu.illinois.ncsa.domain.dao.DatasetDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.ExecutionDao
  • edu.illinois.ncsa.domain.dao.FileDescriptorDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.HPCJobInfoDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.LogFileDao
  • edu.illinois.ncsa.domain.dao.PersonDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.SubmissionDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowStepDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowToolDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowToolDataDao
  • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.dao.WorkflowToolParameterDao
• edu.illinois.ncsa.gondola.IStoppable
  • edu.illinois.ncsa.gondola.ISubmissionEngineImpl (also extends java.lang.Runnable)
• edu.illinois.ncsa.gondola.ISubmissionEngine
• edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.tool.JavaTool
• java.lang.Runnable
  • edu.illinois.ncsa.gondola.ISubmissionEngineImpl (also extends edu.illinois.ncsa.gondola.IStoppable)

Enum Hierarchy

• java.lang.Object
  • java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.WorkflowToolParameter.ParameterType
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.domain.Execution.State
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.java.tool.Parameter.ParameterType
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.commandline.CommandLineOption.Type
    • edu.illinois.ncsa.datawolf.executor.commandline.CommandLineOption.InputOutput
    • edu.illinois.ncsa.gondola.types.submission.JobStateType